標題摘要內容
RNA sequencing
mRNA測序
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2017-09-02 | 8588 次瀏覽 | 分享到:

真核生物mRNA測序的研究對象為特定細胞或組織在某一功能狀態下轉錄出來的mRNA集合,通過oligo-dT磁珠捕獲帶polyA尾的RNA進行建庫測序,也稱為PolyA-Seq。可研究mRNA差異表達或檢測結構變異,篩選與疾病或性狀相關的分子標記;還可揭示轉錄組的復雜性,確定基因以及轉錄本結構、可變剪接、RNA編輯、帶polyA尾的非編碼RNA 和新轉錄本。目前已廣泛應用于基礎研究、分子育種、臨床診斷和藥物研發等領域。

 

技術路線

 

樣品要求


樣品類型:細胞、新鮮組織或完整性良好的Total RNA樣品。

物種:真核生物(詳詢技術支持)

?具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。

 

測序方案

測序模式 PE150

測序數據量 6Gb 


生物信息分析內容

1 原始數據質控檢查

2 比對結果質控檢查

3 基于基因表達的樣品主成分分析

4 差異基因表達分析

5 差異基因GO功能分析

6 差異基因通路分析

7 變異剪切分析 (40M pair end reads

8 基因突變分析(40M pair end reads

9 轉錄調控活性分析及通路互作分析



高通量測序附錄

高通量測序?
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