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circRNA研究匯總 | 20191209-1215
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2019-12-16 | 178 次瀏覽 | 分享到:

歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索(收集最新發布的circRNA文獻共計28篇,下面我們一起來看看,circRNA研究最近有哪些新進展。檢索式:circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1、 環狀RNA——circFGFR1通過海綿吸附miR-381-3p促進非小細胞肺癌進展和PD-1抵抗。

標題Circular RNA circFGFR1 promotes progression and anti-PD-1 resistance by sponging miR-381-3p in non-small cell lung cancer cells.

雜志Mol Cancer

IF10.679

通訊作者Fei Wang 1 , Jing Wu 和 張雪梅(上海東方醫院腫瘤科

 
免疫逃逸,遠端轉移和細胞增殖增加是非小細胞肺癌(NSCLC)進展和NSCLC患者死亡的主要原因。環狀RNA的失調在NSCLC的發展中起著至關重要的作用。因此,進一步了解異常表達的circRNA的生物學機制對于發現新的,有希望的NSCLC治療靶點至關重要。該研究通過RT-qPCR檢測NSCLC及配對的非腫瘤組織和細胞系中環狀RNA——circFGFR1的表達。CCK-8,克隆形成,劃痕愈合和Matrigel Transwell細胞功能實驗分析評估了circFGFR1在NSCLC進展中的作用,體內異種移植動物實驗檢測了circFGFR1的功能,circRNA-RIP,RNA-pulldown和熒光素酶報告基因檢測探索了circFGFR1和miR-381-3p之間的相互作用。實驗結果表明,circFGFR1在NSCLC組織中上調,并且circFGFR1表達與NSCLC患者的不良臨床病理特征和預后相關。過表達circFGFR1促進了NSCLC細胞的遷移,侵襲,增殖和免疫逃逸。分子機制上,circFGFR1可以直接與miR-381-3p相互作用,作為miRNA海綿體來上調miR-381-3p靶基因趨化因子受體4—CXCR4的表達,從而促進NSCLC的發展和對抗PD-1的治療。該研究成果,表明circFGFR1在非小細胞肺癌細胞的增殖,遷移,侵襲和免疫逃逸中的關鍵作用,并為非小細胞肺癌發展過程中的circRNA的作用機制提供了新的視角。


圖注:circFGFR1在非小細胞肺癌患者組織中高表達且與不良預后相關

 

2、 Circ_0001955通過海綿吸附miR-516a-5p釋放TRAF6和MAPK11表達促進肝細胞癌(HCC)的腫瘤發生。

標題Circ_0001955 facilitates hepatocellular carcinoma (HCC) tumorigenesis by sponging miR-516a-5p to release TRAF6 and MAPK11.

雜志Cell Death & Disease

IF5.959
通訊作者林楠(中山大學附屬第三醫院肝膽外科)

 
該研究論文主要探討了circRNA在HCC中的復雜機制。研究者首先從三個GSE數據集(GSE7852,GSE94508和GSE97322)中識別出一種新型circRNA——circ_0001955,circ_0001955在HCC和正常樣品之間存在顯著差異表達。實驗結果表明,與鄰近的正常組織相比,HCC腫瘤組織中的circ_0001955,TRAF6和MAPK11水平升高,而miR-516a-5p水平降低。人為敲低circ_0001955在體外和體內實驗中均抑制了HCC腫瘤細胞的生長,而circ_0001955的過表達則表現出相反的作用。Circ_0001955被鑒定為miR-145-5p和miR-516a-5p的海綿,并且TRAF6和MAPK11被證明是miR-516a-5p的兩個靶基因。總之,circ_0001955通過使miR-516a-5p海綿化以釋放TRAF6和MAPK11表達來促進肝癌的發生。

圖注:HCC中 miR-516a-5p, TRAF6, MAPK11 和 circ_0001955的相互調控關系

 

3、 circCLK3/miR-320a/FoxM1信號軸可促進宮頸癌的進展。

標題The novel circCLK3/miR-320a/FoxM1 axis promotes cervical cancer progression.

雜志Cell Death & Disease

IF5.959

通訊作者李紅雨 秦巧紅(鄭州大學第三附屬醫院婦產科)

 

該研究報道了circRNA在宮頸癌中的詳細功能。研究者首先通過circRNA微陣列芯片篩選了宮頸癌組織和鄰近正常組織之間差異表達的circRNAcircCLK3差異表達水平與臨床病理特征和預后相關。體外CCK-8,細胞計數,細胞集落,細胞劃痕愈合,transwell遷移和侵襲實驗以及體內腫瘤形成和肺轉移動物模型評估circCLK3的功能。使用RNA-pulldownRNA免疫沉淀(RIP),螢光素酶報告基因和功能挽救實驗闡明circCLK3miR-320a之間的相互作用以及miR-320aFoxM1的調控。研究結果表明,在宮頸癌組織中,circCLK3的水平顯著高于癌旁正常組織,并且與腫瘤分化,FIGO分期和基質浸潤深度密切相關。circCLK3的敲低明顯抑制了宮頸癌在體外和體內的細胞生長和轉移,而過表達circCLK3顯著促進了體外和體內的癌細胞生長和轉移。RNA-pulldown和熒光素酶報告基因和RIP實驗分析表明circCLK3直接與miR-320a結合充當miRNA海綿,而MiR-320a通過直接結合FoxM1 mRNA3'UTR抑制FoxM1的表達。此外,FoxM1可促進宮頸癌的細胞增殖,遷移和侵襲,而miR-320a通過抑制FoxM1抑制細胞增殖,遷移和侵襲,而circCLK3通過海綿吸附miR-320a并促進FoxM1表達來增強細胞增殖,遷移和侵襲。綜上所述,circCLK3可以作為宮頸癌進展的新型診斷生物標志物和治療的分子靶標。


圖注:circCLK3在裸鼠異種移植模型中促進宮頸癌細胞增殖和轉移

 

 

文獻列表:

序號

主要內容

論文標題

雜志

IF

單位

1

環狀RNA——circFGFR1通過海綿吸附miR-381-3p促進非小細胞肺癌進展和PD-1抵抗。

Circular RNA circFGFR1 promotes progression and anti-PD-1 resistance by sponging miR-381-3p in non-small cell lung cancer cells.

Mol Cancer

10.679

上海東方醫院腫瘤科

2

具有單鏈環狀RNA作為siRNA前體的細胞行使RNAi功能。

Intracellular build-up RNAi with single-strand circular RNAs as siRNA precursors.

Chem Commun (Camb)

6.164

日本名古屋大學

3

circCLK3/miR-320a/FoxM1信號軸可促進宮頸癌的進展。

The novel circCLK3/miR-320a/FoxM1 axis promotes cervical cancer progression.

Cell Death Dis

5.959

鄭州大學第三附屬醫院婦產科

4

Circ_0001955通過海綿吸附miR-516a-5p釋放TRAF6和MAPK11表達促進肝細胞癌(HCC)的腫瘤發生。

Circ_0001955 facilitates hepatocellular carcinoma (HCC) tumorigenesis by sponging miR-516a-5p to release TRAF6 and MAPK11.

Cell Death Dis

5.959

中山大學附屬第三醫院

5

CircPTPRA通過使miR-636海綿化并上調KLF9,在膀胱癌中起到抑癌作用。

CircPTPRA acts as a tumor suppressor in bladder cancer by sponging miR-636 and upregulating KLF9.

Aging (Albany NY)

5.515

中山大學孫逸仙紀念醫院

6

環形RNA血管動蛋白樣1對AKT的轉錄后調節介導了乳腺癌細胞對紫杉醇的化學耐藥性。

Posttranscriptional regulation of AKT by circular RNA angiomotin- like 1 mediates chemoresistance against paclitaxel in breast cancer cells.

Aging (Albany NY)

5.515

森尼布魯克健康科學中心

7

CircHECTD1通過HECTD1介導肺成纖維細胞活化。

CircHECTD1 mediates pulmonary fibroblast activation via HECTD1.

Ther Adv Chronic Dis

4.455

東南大學醫學院生理學系

8

CircSLNN:通過序列標記神經網絡識別circRNA上的RBP結合位點。

CircSLNN: Identifying RBP-Binding Sites on circRNAs via Sequence Labeling Neural Networks.

Front Genet

3.517

上海交通大學計算機科學與工程系等

9

線粒體mRNA片段在人類HEK細胞系中環化。

Mitochondrial mRNA Fragments are Circularized in a Human HEK Cell Line.

Mitochondrion

3.449

弗吉尼亞大學懷斯分校

10

環狀RNA ITCH通過海綿吸附miR-17-5p增加HOXB13表達來抑制前列腺癌的進展。

Circular RNA ITCH suppressed prostate cancer progression by increasing HOXB13 expression via spongy miR-17-5p.

Cancer Cell Int

3.439

廈門大學第一附屬醫院泌尿外科

11

環狀RNA H19的敲低通過多嘧啶束結合蛋白1誘導人脂肪干細胞成脂分化。

Knock-down of circular RNA H19 induces human adipose-derived stem cells adipogenic differentiation via a mechanism involving the polypyrimidine tract-binding protein 1.

Exp Cell Res

3.329

浙江大學醫學院附屬邵逸夫醫院內分泌科

12

冠狀動脈疾病中的環狀RNA譜。

Circular RNA profile in coronary artery disease.

Am J Transl Res

3.266

東南大學附屬中大醫院心血管內科

13

低氧誘導的環狀RNA has_circRNA_403658通過激活LDHA促進膀胱癌細胞的生長。

Hypoxia-induced circular RNA has_circRNA_403658 promotes bladder cancer cell growth through activation of LDHA.

Am J Transl Res

3.266

鄭州大學第一附屬醫院麻醉科

14

EBV病毒相關的胃癌研究

Thirty years of Epstein-Barr virus-associated gastric carcinoma.

Virchows Arch

2.868

日本千葉大學醫學研究科

15

類固醇誘導的股骨頭壞死中差異表達的環狀RNA的表達譜分析。

Expression Profile Analysis of Differentially Expressed Circular RNAs in Steroid-Induced Osteonecrosis of the Femoral Head.

Dis Markers

2.761

浙江省中醫骨傷研究所

16

MC-LR處理人正常肝細胞系(HL7702)細胞后高通量測序分析環狀RNA表達譜。

Circular RNA expression profiles following MC-LR treatment in human normal liver cell line (HL7702) cells using high-throughput sequencing analysis.

J Toxicol Environ Health A

2.649

中南大學湘雅公共衛生學院等

17

非編碼RNA在抑郁癥發病機制中的作用。

Role of Non-coding RNA in the Pathogenesis of Depression.

Gene

2.638

北京協和醫學院藥物研究所

18

一種使用部分比對的reads進行指導性比對可以實現單核苷酸分辨率靈敏地檢測環狀DNA的方法。

Sensitive detection of circular DNAs at single-nucleotide resolution using guided realignment of partially aligned reads.

BMC Bioinformatics

2.511

丹麥哥本哈根大學

19

在阿爾茨海默氏病患者的外周血單核細胞中差異表達的環狀RNA的分析。

Profiling of differentially expressed circular RNAs in peripheral blood mononuclear cells from Alzheimer's disease patients.

Metab Brain Dis

2.411

濟寧醫學院附屬醫院神經內科

20

CircCDYL作為被套細胞淋巴瘤中的新生物標記物,并促進細胞增殖。

CircCDYL Serves as a New Biomarker in Mantle Cell Lymphoma and Promotes Cell Proliferation.

Cancer Manag Res

2.243

鄭州大學第一附屬醫院

21

下調的環狀RNA hsa_circ_0000291通過靶向miR-183/ITGB1軸抑制胃癌的遷移和增殖。

Downregulated Circular RNA hsa_circ_0000291 Suppresses Migration And Proliferation Of Gastric Cancer Via Targeting The miR-183/ITGB1 Axis.

Cancer Manag Res

2.243

同濟大學附屬第十人民醫院血管外科

22

腦死亡大鼠供者肝移植后肝中lncRNA和circRNA表達譜的微陣列分析。

Microarray Analysis For Expression Profiles of lncRNAs and circRNAs in Rat Liver after Brain-Dead Donor Liver Transplantation.

Biomed Res Int

2.197

鄭州大學第一附屬醫院等

23

調節2型糖尿病胰島β細胞自噬的環狀RNA的鑒定。

Identification of Circular RNAs Regulating Islet β-Cell Autophagy in Type 2 Diabetes Mellitus.

Biomed Res Int

2.197

三亞中心醫院內分泌科

24

血清circ_0068481升高的水平可作為特發性肺動脈高壓的潛在診斷和預后指標。

Elevated serum circ_0068481 levels as a potential diagnostic and prognostic indicator in idiopathic pulmonary arterial hypertension.

Pulm Circ

2.075

廣東省心血管病研究所

25

血府逐瘀膠囊對氣滯血瘀型患者的敏感生物標志物分析:嵌套病例對照研究。

Sensitive Biomarker Analysis of Xue-Fu-Zhu-Yu Capsule for Patients with Qi Stagnation and Blood Stasis Pattern: A Nested Case-Control Study.

Evid Based Complement Alternat Med

1.984

廣安門醫院心內科

26

circCDYLmicroRNA-105-5p參與調節結腸癌細胞的生長和遷移。

circCDYL/microRNA-105-5p participates in modulating growth and migration of colon cancer cells.

Gen Physiol Biophys

1.309

寧波市醫療中心李惠利醫院

27

急性髓系白血病耐藥細胞中Circrna,Lncrna和Mrna的表達譜篩選及生物信息學分析

Expression Profile Screening and Bioinformatics Analysis of Circrna, Lncrna and Mrna in Acute Myeloid Leukemia Drug-Resistance Cells

Turk J Haematol

0.779

廈門大學附屬中山醫院血液科

28

環狀RNA hsa_circ_0014130在肺腺癌細胞系中的表達及其對肺腺癌細胞增殖和侵襲的影響。

Expression of circular RNA hsa_circ_0014130 in lung adenocarcinoma cell lines and its effect on proliferation and invasion of lung adenocarcinoma cell line.

Zhonghua Bing Li Xue Za Zhi

Not Found

天津市第四中心醫院腫瘤介入科


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